Ngày 11/01/2010 Bộ tài chính đã ban hành thông tư số 02/2010/TT-BTC hướng dẫn bổ sung Thông tư số 84/2008/TT-BTC ngày 30/9/2008 của Bộ Tài chính hướng dẫn thi hành một số điều của Luật thuế thu nhập cá nhân và hướng dẫn thi hành Nghị định số 100/2008/NĐ-CP ngày 08/9/2008 của Chính phủ quy định chi tiết một số điều của Luật thuế Thu nhập cá nhân.

Đáng chú ý là Thông tư 02 đã thống nhất phương án tính thuế thu nhập cá nhân đối với hoạt động chuyển nhượng bất động sản, cho phép người nộp thuế được tự xác định mức thuế suất áp dụng và chịu trách nhiệm trước pháp luật về những thông tin kê khai.

Theo đó, cá nhân có thu nhập từ chuyển nhương bất động sản áp dụng thuế suất 25% tính trên thu nhập tính thuế khi đáp ứng các điều kiện sau: (i) Giá chuyển nhượng ghi trên hợp đồng chuyển nhượng và kê khai trên tờ khai thuế không thấp hơn giá do Ủy ban nhân dân tỉnh quy định (đối với quyền sử dụng đất) hoặc giá tính lệ phí trước bạ do Ủy ban Nhân dân cấp tỉnh quy định (đối với nhà và các công trình xây dựng); (ii) Giá mua và các chi phí liên quan có hóa đơn, chứng từ hợp pháp. Các trường hợp chuyển nhượng bất động sản không đáp ứng một trong các điều kiện trên sẽ thống nhất áp dụng thuế suất 2% tính trên tổng giá trị hợp đồng.

Đối với cá nhân chuyển nhượng hợp đồng góp vốn để có quyền mua nền nhà, mua căn hộ thì giá mua được xác định căn cứ vào chứng từ nộp tiền góp vốn và hóa đơn, chứng từ khác chứng minh các chi phí liên quan. Các chi phí liên quan đến việc chuyển nhượng bất động sản bao gồm cả các khoản lãi trả tiền vay của các tổ chức tín dụng để mua bất động. Riêng trường hợp chưa nộp đủ số tiền theo hợp đồng, giá mua được xác định bằng tổng số vốn phải góp theo hợp đồng trừ phần vốn góp chưa nộp, sau đó cộng thêm các chi phí có liên quan khác.

Một trong những điểm quan trọng của Thông tư 02/2010/TT-BTC là bổ sung một số khoản thu nhập từ tiền lương, tiền công vào danh sách thu nhập không chịu thuế. Trong đó có các khoản cụ thể là tiền của cán bộ công chức luân chuyển công tác được hưởng chế độ nhà công vụ, xe phục vụ công tác...

Bên cạnh đó, thông tư này cũng quy định bãi bỏ quy định phạt hành chính khai quyết toán thuế quá thời hạn. Cơ sở để đưa ra quy định này là trên thực tế, chính cơ quan thuế đã giữ tiền thuế, thậm chí là giữ một khoản tiền nhiều hơn mức áp thuế của cá nhân đó.

Thông tư này có hiệu lực thi hành sau 45 ngày kể từ ngày ký và được áp dụng ngay đối với thu nhập từ chuyển nhượng bất động sản. Riêng cá nhân cư trú có thu nhập từ tiền lương, tiền công, từ kinh doanh được áp dụng cho kỳ tính thuế năm 2009.