Ngày 23/3/2010, Bộ Tài chính ban hành Thông tư số 40/2010/TT-BTC hướng dẫn việc xác định thu nhập chịu thuế đối với khoản chênh lệch do đánh giá lại tài sản.

Theo đó, việc xác định thu nhập chịu thuế đối với các khoản chênh lệch do đánh giá lại TSCĐ để góp vốn, để điều chuyển khi chia, tách, hợp nhất, sáp nhập, chuyển đổi loại hình doanh nghiệp được thực hiện như sau:

 - Chênh lệch do đánh giá lại TSCĐ để góp vốn được phân bổ dần vào thu nhập khác khi xác định thu nhập chịu thuế TNDN tại doanh nghiệp có tài sản đánh giá lại đem góp vốn, việc phân bổ dần được tính theo số năm còn lại được trích khấu hao của TSCĐ tại doanh nghiệp nhận vốn góp;

- Chênh lệch do đánh giá lại TSCĐ để điều chuyển tài sản khi chia, tách, sáp nhập, hợp nhất, chuyển đổi loại hình doanh nghiệp tính một lần vào thu nhập khác khi xác định thu nhập chịu thuế TNDN tại doanh nghiệp có tài sản đánh giá lại để điều chuyển.

Ngoài ra, Thông tư 40 cũng hướng dẫn cụ thể việc xử lý chênh lệch do đánh giá lại quyền sử dụng đất có thời hạn và quyền sử dụng đất lâu dài như sau:

- Đối với chênh lệch do đánh giá lại giá trị quyền sử dụng đất có thời hạn, trường hợp bên nhận quyền sử dụng đất được trích khấu hao đối với giá trị quyền sử dụng đất theo chế độ quy định thì khoản chênh lệch do đánh giá lại giá trị quyền sử dụng đất phải tính vào thu nhập khác khi xác định thu nhập chịu thuế TNDN;

- Đối với chênh lệch do đánh do đánh giá lại giá trị quyền sử dụng đất lâu dài để góp vốn, trường hợp bên nhận quyền sử dụng đất có đưa giá trị quyền sử dụng đất vào hoạt động sản xuất kinh doanh nhưng không được trích khấu hao theo chế độ quy định thì phần chênh lệch này tạm thời chưa tính thuế TNDN. Trường hợp sau khi góp vốn, doanh nghiệp lại tiếp tục mang quyền sử dụng đất đi góp vốn cho đơn vị khác thì đơn vị nhận vốn góp phải kê khai phải kê khai và nộp thuế TNDN.

- Đối với chênh lệch do đánh giá lại quyền sử dụng đất để góp vốn vào các dự án đầu tư xây dựng nhà, hạ tầng để bán thì khoản chênh lệch được tính một lần vào thu nhập khác khi xác định thu nhập chịu thuế TNDN tại doanh nghiệp có tài sản đánh giá lại đem góp vốn.

Thông tư này có hiệu lực sau 45 ngày kể từ ngày ký và được áp dụng cho việc quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp từ năm 2009.